Mitokondriyal DNA korunmuş yapı ve organizasyon özelliklerinden dolayı, tür içi ve türler arası genetik çeşitliliği belirlemede yaygın olarak kullanılmaktadır. DNA kullanılarak, hem sistematik hem de genetik çalışmalar için, rasgele çoğaltılmış polimorfik DNA Polimeraz Zincir Reaksiyonu (RAPD- PCR) tekniği kullanılabilmektedir. RAPD-PCR ekonomik olması ve genomik bilgiye ihtiyaç duyulmaması nedeniyle genetik uzaklıkların belirlenmesi için tercih edilmiştir.
Bu çalışmada, Palaemon elegans türünden izole edilen mitokondriyal DNA'ların 39 primerle amplifikasyonu denenmiştir. Denenen primerlerden 4 tanesinin verdiği amplifikasyon sonuçlarına göre bu türün, tür içi polimorfizmi araştırılmıştır.